少年三国志3中的神兽系统是提升战力的核心玩法之一，不同品质的神兽拥有独特的技能效果和战斗机制。红神兽机关鸟的技能触发条件为敌方武将阵亡时，对敌方后排造成大量无视防御的神兽伤害，并有概率附加灼烧状态，每回合扣除释放者一定百分比武将平均攻击的生命值，持续一定回合，每场战斗仅触发一次。该神兽更适合吴国阵容，能与火属性武将形成联动，强化整体输出能力。
金神兽撼地灵犀的技能在第一回合结束时触发，对敌方前排造成912%无视防御的神兽伤害，并有45%概率使目标进入眩晕状态1回合，同时100%概率使生命百分比最高的敌方武将眩晕2回合。该神兽在PVE和PVP中均有出色表现，高额爆发与控制效果可有效压制敌方输出，尤其适合低战力玩家实现越级挑战。撼地灵犀与同为前排杀手的机关牛相比，触发条件更稳定且附带控制，综合性能更优。
紫金神兽天禄貔貅是当前版本中攻防一体的顶级神兽，其技能在我方全体血量首次降至60%以下时触发，对敌方前排造成无视防御的伤害并回复我方全体生命值，溢出治疗转化为护盾，同时为随机一名友方附加伤害吸收、反弹或免疫效果。与金神兽神木青鸾相比，天禄貔貅的触发阈值更低、治疗量更高，且兼具输出与生存增益，是后期阵容的核心选择。
橙神兽猞猁的技能在敌方全体血量首次降至60%以下时触发，对随机一列造成无视防御的伤害并降低目标抗暴率。该神兽适合暴击流派阵容，尤其是蜀国武将体系，但需注意其技能可能被高治疗或肉盾阵容克制。紫神兽巨猿则在第一回合结束时对随机单体造成高额伤害并降低格挡率，虽输出可观但随机性较强，更适合前期过渡使用。
神兽技能效果与阵容搭配密切相关，例如灼烧系神兽适配吴国火伤阵容，控制型神兽适合魏国防御体系。玩家需根据自身阵容特点选择神兽，并通过升星、装备强化进一步提升技能效果。随着版本更新，紫金神兽逐渐成为主流，但部分金神兽和红神兽在特定场景中仍具战略价值。
